Předmět Základy experimentálních metod biofyziky (KBF / SZZM2)
Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu KBF / SZZM2 - Základy experimentálních metod biofyziky, Přírodovědecká fakulta, Univerzita Palackého v Olomouci (UP).
Top 10 materiálů tohoto předmětu
Materiály tohoto předmětu
| Materiál | Typ | Datum | Počet stažení |
|---|
Další informace
Obsah
1. Klasická světelná mikroskopie. Teorie optického zobrazení. Konstrukce a konstrukční prvky. Zobrazovací metody (polarizační, fluorescenční, UV a IČ). Fázový, Nomarského a Hoffmanův kontrast. Příprava preparátů. Zásady při mikroskopování.2. Moderní světelná mikroskopie. Konfokální laserová a tandemová mikroskopie. Mikroskopie blízkého a evanescentního pole, chemická, kinetická, statistická mikroskopie. Měření a záznam obrazu, počítačová analýza obrazu.3. Teorie struktury ideálního krystalu. Grupy symetrie. Značení bodů, směrů a rovin v krystalu, omezení četnosti vlastních os otáčení. Bravaisovy elementární buňky. Projekce krystalu. Reálné krystaly, poruchy v krystalech. Kvazikrystaly.4. Teorie difrakce rentgenového záření. Braggova rovnice, reciproká mříž, Laueho podmínky, Ewaldova konstrukce. Intenzita difrakčních maxim, atomový a strukturní faktor. Vyhasínání reflexí. Friedelův zákon. Funkce elektronové hustoty. Řešení problému fáze.5. Základy teorie elektronové mikroskopie. Elektron jako vlna ve vakuu, interakce elektronu s pevnou látkou. Difrakce elektronů. Příprava vzorků pro elektronový mikroskop.6. Mikroskopie se skenující sondou. Skenující tunelová mikroskopie, Mikroskopie atomárních sil, Mikroskopie magnetických sil, Mikroskopie elektrostatických sil, Mikroskopie laterálních sil, Skenovací kapacitní mikroskopie, Skenovací teplotní mikroskopie, Skenovací optická mikroskopie v blízkém poli, příbuzné metody ze skupiny SPM metod.7. Absorpční spektroskopie v UV-VIS oblasti. Kvantově mechanický popis stavů molekul, aproximace. Franck-Condonův princip. Elektronové struktury molekul, typy přechodů. Rychlost absorpce. Barevné komplexy. Izobestické body.8. Teorie luminiscence. Rozdělení luminiscencí a základní zákony. Jablonského schéma excitovaných stavů organických molekul. Fluorescence a fosforescence. Zpožděné typy emisí.9. Základní charakteristiky fluorescence. Intenzita, Emisní a excitační spektra, kvantový výtěžek a kinetika dohasínání fluorescence. Metody jejich měření.10. Pokročilé fluorescenční techniky. Statické a dynamické zhášení fluorescence, Stern-Volmerova rovnice. FRET. FCS a FRAP. Měření s polarizovaným světlem.11. Spektroskopie polarizovaného světla. Lineární a cirkulární dichroismus, polarizovaná luminiscence, rozptyl polarizovaného světla, experimentální uspořádání.12. Fotoakustická spektroskopie. Přímý a nepřímý fotoakustický jev, metody fotoakustické spektroskopie. Porovnání absorpční a fotoakustické spektroskopie. Použití v biologii.13. Spektroskopie založené na rozptylu, ohybu, odrazu a lomu. Elastický rozptyl na malých a velkých molekulách, kvazielastický rozptyl, rozptyl na difúzních vzorcích (nefelometrie a turbidimetrie), experimentální uspořádání. Spektroskopická interferometrie, reflektometrie a refraktometrie. Použití v biologii.14. Vibrační a rotační absorpční spektroskopie, spektroskopie Ramanova rozptylu. Klasická a kvantová teorie malých vibrací, IČ spektra, metody vibrační spektroskopie, experimentální uspořádání. Klasická a kvantová teorie rotace molekul, rotační spektra, experimentální uspořádání. Teorie Ramanova rozptylu, Ramanova spektra, metody spektroskopie Ramanova rozptylu, experimentální uspořádání. Porovnání vibrační spektroskopie a spektroskopie Ramanova rozptylu. Použití v biologii.
Získané způsobilosti
Uchazeč ovládá teoretické základy biofyzikálních metod.
Požadavky
Uchazeč musí prokázat všeobecný přehled o biofyzikálních metodách a jejich aplikacích a diskutovat o nich v širších souvislostech.
Garant
doc. RNDr. Martin Kubala, Ph.D.