Předmět Biofyzikální chemie (KFC / BFCH)
Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu KFC / BFCH - Biofyzikální chemie, Přírodovědecká fakulta, Univerzita Palackého v Olomouci (UP).
Top 10 materiálů tohoto předmětu
Materiály tohoto předmětu
| Materiál | Typ | Datum | Počet stažení |
|---|
Další informace
Obsah
Termodynamika v biochemii, entropie, disipativní děje, hnací síly dějů v organismu, získávání a ukládání energie. Voda a roztoky solí jako prostředí pro biochemické děje.Organismus jako otevřený systém v ustáleném stavu. Kinetika, nestacionární termodynamika, oscilatorní reakce v komplexních systémech, biorytmy, farmakokinetika.Proteiny, struktura, strukturní motivy a domény, stabilita, význam nevazebných interakcí, hydrofobní efekt a "hrůza z vakua", další faktory stabilizující proteiny, Ramachandranův diagram, sbalování proteinů jako kombinatorická úloha, úloha entropie, mechanismy sbalování. Principy enzymové katalýzy. Interakce proteinů s ligandy a inhibitory, dokování.Lipidy, membrány, samoorganizace, povrchové napětí, modelování membrán, koncentrační spády a potenciály na membránách, membránové proteiny, transport přes membránu.Nukleové kyseliny, formy DNA, stabilita a sbalování RNA, strukturní motivy v RNA, vliv iontů, rozpouštědla a iontové síly. Interakce DNA a RNA s proteiny, molekulové rozpoznávání.Metody studia biomolekul. Spektroskopie, mikroskopické metody, kryoelektronová mikroskopie, fluorescence, NMR, rentgenová difrakce, hmotnostní spektrometrie, kalorimetrické metody. Silné stránky a omezení jednotlivých metod.Modelování biomolekul. Počítačové modelování, provedení a postupy, informace, které modelování nabízí. Kombinace modelování a experimentu.
Získané způsobilosti
Porozumění fyzikálně-chemickým principům někkterých biologických dějů a aplikace znalostí na analogické problémy.
Literatura
Tsai C.S. An Introduction to Computational Biochemistry, Wiley, 2002. Kalous V., Pavlíček Z. Biofysikální chemie. SNTL Praha, 1980. Kodíček, M., Karpenko, V. Biofyzikální chemie. Academia Praha, 2000. Cooper A. Biophysical Chemistry, The Royal Society of Chemistry, 2004. Vodrážka,Z. Fyzikální chemie pro biologické vědy. Academia Praha, 248 s. Finkelstein A., Ptitsyn O.B. Protein Physics, Academic Press, 2002.
Požadavky
Student musí být schopen diskuse na uvedené téma (dvě otázky).
Garant
doc. RNDr. Petr Jurečka, Ph.D.
Vyučující
doc. RNDr. Petr Jurečka, Ph.D.