Předmět Drug design - racionální návrh léčiv (KFC / DD)
Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu KFC / DD - Drug design - racionální návrh léčiv, Přírodovědecká fakulta, Univerzita Palackého v Olomouci (UP).
Top 10 materiálů tohoto předmětu
Materiály tohoto předmětu
Materiál | Typ | Datum | Počet stažení |
---|
Další informace
Obsah
Drug design, nebo také racionální návrh léčiv je hledání nových léčiv za pomoci znalosti biologického cíle. Jedná se o celou škálu nejčastěji počítačových technik, které mají za cíl napomoci s výběrem látek pro biologické testování. V interaktivním kurzu zkombinujeme přednášky a cvičení na počítačích schopných zobrazovat 3D grafiku tak, aby si účastníci kurzu mohli sami vyzkoušet metodiku racionálního návrhu léčiv. Zmíníme se jak o metodách vyžadujících znalost struktury biologického cíle (nejčastěji molekuly proteinu cílového receptoru), tzv. "structure-based drug design", tak i o metodách zaměřených predikci aktivity látek na základě vlastností struktury jednotlivých testovaných látek, pokud neznáme strukturu cíle, tzv. "ligand-based drug design". V první skupině je zapotřebí odhalit na proteinu místokam se testované látky váží a zjistit jak pevně, tzv. "docking" a to pokud možno s celou databází látek, tzv. "virtual screening". V druhé skupině jde především o dedukci pravidel ze známých experimentálních dat pomocí tzv. QSAR metod. Při návrhu léčiva je dále nutné brát ohled i na jeho osud v organismu a odhadnout i jeho průnik do organismu, vliv metabolismu a odhalit i případnou toxicitu. Ne vše jsme nicméně schopni dnes předpovědět a proto se zmíníme i o limitacích jednotlivých metod drug designu.
Získané způsobilosti
Definovat hlavní pojmy, popsat hlavní přístupy aplikované na návrh léčiv in silico metodami a jejich vyzkoušení na modelových příkladech.
Literatura
Young, D.C. Computational Drug Design. Wiley, 2009. Young D.C. Computational Chemistry, a Practical Guide for Applying Techniques to Real World Problems. Wiley, 2001. Leach AR. Molecular Modelling - Principles and Applications (2 edition). Pearson Education, 2001. Alvarez, J. & Shoichet B. (Eds.). Virtual Screening in Drug Discovery. Taylor&Francis, 2005.
Požadavky
Prokázat schopnost diskutovat na téma zvolené zkoušejícím.
Garant
RNDr. Karel Berka, Ph.D.
Vyučující
RNDr. Karel Berka, Ph.D.