Předmět Molekulové modelování (KFC / PGSMM)
Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu KFC / PGSMM - Molekulové modelování, Přírodovědecká fakulta, Univerzita Palackého v Olomouci (UP).
Top 10 materiálů tohoto předmětu
Materiály tohoto předmětu
| Materiál | Typ | Datum | Počet stažení |
|---|
Další informace
Obsah
1. popis molekuly v souřadném systému, kartézské a vnitřní souřadnice, možnosti konverze, běžné typy datových souborů a jejich formáty, zobrazení molekuly, různé typy zobrazení molekul, povrchy molekul atp.2. molekulová mechanika, silové pole a jeho jednotlivé příspěvky; problémy elektrostatických a van der Waalsových příspěvků, možnosti a aplikace MM3. klasická molekulová dynamika, simulační protokoly, praktické možnosti nasazení metody, limitace4. hyperplocha potenciální energie, metody procházení energetických hyperploch, konformační prohledávání5. počítačové simulace, výpočet termodynamických funkcí, praktické aspekty simulací, periodické boxy, dlouhodosahové síly6. Solvent7. QM/MM metody
Získané způsobilosti
Hodnotit konkrétní metody a postupy, vysvětlit výsledky získané metodami molekulového modelování
Garant
prof. RNDr. Michal Otyepka, Ph.D.
Vyučující
prof. RNDr. Michal Otyepka, Ph.D.