Předmět Strukturální bioinformatika (KFC / STBI)
Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu KFC / STBI - Strukturální bioinformatika, Přírodovědecká fakulta, Univerzita Palackého v Olomouci (UP).
Top 10 materiálů tohoto předmětu
Materiály tohoto předmětu
| Materiál | Typ | Datum | Počet stažení |
|---|
Další informace
Obsah
Popis struktury biomolekul a jejich hierarchie, proteiny, nukleové kyselinyUkládání struktury, formáty a její získávání experimentem - X-ray krystalografie, NMR, EM a další technikyDatabáze PDB, NDBOstatní databáze (CATH, SCOP, Drugbank)Vizualizace struktury, strukturní porovnáváníPredikce struktury a funkceKontrola kvality predikce, CASPHledání léčiv - Docking, klastrováníVýzvy strukturní bioinformatiky - membránové proteiny, nukleové kyseliny, predikce protein-proteinových interakcí
Získané způsobilosti
Definovat hlavní pojmy, popsat hlavní přístupy aplikované na strukturní bioinformatiku proteinů
Literatura
Bourne P. & Helge W. (Eds.). Structural Bioinformatics. Wiley, 2003. Zvelebil, M. & Baum, J. Understanding Bioinformatics. Garland Science, 2007. Voet D. & Voet JG. Biochemistry (3rd edition). Wiley, 2004. Orengo CA., Jones DT., Thornton JM. (Eds.). Bioinformatics - Genes, Proteins and Computers. Bios Scientific Publishers Ltd., 2003. Leach AR. Molecular Modelling - Principles and Applications (2 edition). Pearson Education, 2001. Eidhammer I., Jonassen I., & Taylor WR. Protein Bioinformatics - An Algorithmic Approach to Sequence and Structure Analysis. Wiley, 2004.
Požadavky
Student musí prokázat schopnost diskutovat na téma zvolené zkoušejícím (2 otázky) a zároveň úspěšně vyřešit bioinformatickou úlohu podle prováděných cvičení.
Garant
RNDr. Karel Berka, Ph.D.
Vyučující
RNDr. Karel Berka, Ph.D.Mgr. Petra Kührová, Ph.D.Mgr. Marie Zgarbová, Ph.D.