Předmět Metabolomika (LRR / MTBL)
Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu LRR / MTBL - Metabolomika, Přírodovědecká fakulta, Univerzita Palackého v Olomouci (UP).
Top 10 materiálů tohoto předmětu
Materiály tohoto předmětu
| Materiál | Typ | Datum | Počet stažení |
|---|
Další informace
Obsah
Úvod. Omics přístupy - metabolomika, genomika, proteomika. Cílená vs. necílená analýza. Metabolic fingerprinting. Vysvětlení základních pojmů. Klasické instrumentace (LC-MS, GC-MS, NMR), jejich popis a specifikace. MS detektory s vysokým rozlišením. Design metabolomického experimentu. Princip diferenční analýzy. Kvantitativní analýza 3D chromatogramů (LC-MS a GC-MS), princip a používaný software. Redukce proměnných seskupením fragmentů. Metody určení přesné hmoty a elementárního složení látek. Předběžná identifikace látek pomocí online databází a specializovaného software. Korelační analýza a metody vizualizace. Transformace a standardizace dat. Metody vícerozměrné analýzy (shluková a ordinační analýza) a jejich interpretace. Kandidáti aktivních látek.Rostlinná a humánní metabolomika, příprava vzorků a používané standardy. Analýza primárních a sekundárních metabolitů. Příklady metabolomických experimentů a instrumentace. Metody vyhledávání biomarkerů.
Získané způsobilosti
Student bude schopen navrhnout metabolomický experiment, vybrat optimální analytické metody a vhodný způsob vyhodnocení experimentálních dat.
Literatura
Wolfram Weckwerth. (2007). Metabolomics. K. Saito, R.A. Dixon, and L.Willmitzer. (2006). Plant Metabolomics. Nigel W. Hardy and Robert D. Hall. (2012). Plant Metabolomics.
Požadavky
70% úspěšnost u písemného testu
Garant
Mgr. Jiří Grúz, Ph.D.
Vyučující
Mgr. Jiří Grúz, Ph.D.