Předmět Genomika (LRR / PGSB6)
Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu LRR / PGSB6 - Genomika, Přírodovědecká fakulta, Univerzita Palackého v Olomouci (UP).
Top 10 materiálů tohoto předmětu
Materiály tohoto předmětu
| Materiál | Typ | Datum | Počet stažení |
|---|
Další informace
Obsah
Obsah genomových projektů. Sekvenování genomů prokaryot. Sekvenování genomů eukaryot - Caenorhabditis elegans, Drosophila melanogaster, Arabidopsis thaliana, Triticum aestivum, Homo sapiens. Databáze sekvencí DNA. Genetické mapování. Mapovací populace. Molekulární markery, jejich typy a příprava. Strategie mapování. Genetické mapy, jejich konstrukce. Knihovny DNA, jejich typy a konstrukce. Fyzické mapování. Metody používané při fyzickém mapování, "fingerprinting". Integrace fyzických a genetických map. Poziční klonování genů, "chromosome walking". Strategie sekvenování DNA ("shotgun", "clone-by-clone", redukční strategie). Anotace sekvencí DNA. Funkční anotace a zařazování genů do rodin. Polymorfismus DNA. SNPs ("single nucleotide polymorphisms") a jejich využití pro "genotyping". Komparativní genomika. Genová exprese a transkriptom. Knihovny cDNA, ESTs ("expressed sequence tags"), DNA arrays a DNA čipy, jejich příprava a využití. Určování funkce genů. Metody funkční genomiky - saturační přímá genetika, vysoko-kapacitní reverzní genetika.
Získané způsobilosti
Student je schopen- vysvětlit a použít moderní techniky pro studium genomů- orientovat se v problematice a vést vědeckou diskusi v širších souvislostech celého oboru
Literatura
Gibson, G., Muse, V.S. A Primer of Genome Science. Sinauer Associates, Inc., Sunderland, 2004. Rashidi, H.H., Buehler, L.K. Bioinformatics Basics. CRC Press, Boca Raton, 2000. Hunt, S. P., Livesey, F. Functional Genomics: A Practical Approach. Oxford University Press, Oxford, 2000. Birren a kol. Genome analysis - Mapping Genomes. Cold Spring Harbor Laboratory Press, New York, 1997. Cantor, C.R., Smith, C.L. Genomics: The Science and Technology Behind the Human Genome Project, John Wiley and Sons, New York, 1999. Brdička, R. Lidský genom na rozhraní tisíciletí. Grada Publishing, Praha, 2001. Cullis, C.A. Plant Genomics and Proteomics. John Wiley and Sons. Inc., New York, 2004. Primrose, S.B. Principles of Genome Analysis: A guide to mapping and sequencing DNA from different organisms. Blackwell Science Inc., 1998. Meksem, K., Kahl, G. The Handbook of Plant Genome Mapping. Wiley-VCH Verlag, Weinheim, 2005.
Požadavky
Doktrorská zkouška
Garant
Ing. Hana Šimková, CSc.
Vyučující
Ing. Hana Šimková, CSc.