Předmět Obecná taxonomie (ZOO / OTXSB)

Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu ZOO / OTXSB - Obecná taxonomie, Přírodovědecká fakulta, Univerzita Palackého v Olomouci (UP).

Materiál	Typ	Datum	Počet stažení

Obsah

Taxonomie jako věda. Význam taxonomie pro ostatní biologické discipliny. Významné osobnosti v dějinách taxonomie. Mikrotaxonomie: Fenon, taxon, kategorie. Kategorie druhu. Koncepce druhu - typologická, nominalistická a biologická. Definice. Taxon druh. Problematika taxonomické klasifikace polyploidních, apomiktických a autogamických rostlin. Hybridní a hybridogenní taxony u rostlin. Polytypické druhy. Význam a rozšíření polytypických druhů. Vnitrodruhové (infraspecifické) kategorie a termíny. Problém poddruhu. Makrotaxonomie: Teorie biologické klasifikace. Hlavní kroky v taxonomické proceduře. Vyšší kategorie a vyšší taxony. Principy hierarchické klasifikace.Taxonomické znaky: morfologické a molekulární markery. Kladistika. Kladistická analýza, homologie a homoplasie. Znaky plesiomorfní a apomorfní. Polarizace znaků. Kladistická klasifikace, Pojetí monofylie (holofylie), rozdíly mezi kladistikou a evoluční systematikou. Metody rekonstrukce fylogeneze: distanční metody, parsimonie, maximum likelihood, bayesiánské inference, metody datování fylogenetických událostí, bayesiánská rekonstrukce ancestrálních znaků. Molekulární fylogenetika: molekulární datové soubory, zpracování chromatogramů, formáty znakových souborů, GEnBANK jako zdroj dat, používaný software pro molekulárně fylogenetické analýzy, multimarkerové soubory, parciální a total evidence analýza, nextgen data ve fylogenetice, studium evoluce znaků, podpora větví. Algoritmické metody delimitace druhů, barcoding, GMYC, PTP model, molekulární znaky pro definici druhů, hodnocení genetické diversity v geografickém prostoru. Mezinárodní pravidla botanické a zoologické nomenklatury (výběr nejdůležitějších pravidel, seznámení s anglicou terminologií, Code v originální anglické verzi).

Získané způsobilosti

Po absolvování kurzu by student měl být schopen:- Vysvětlit základní pojmy taxonomie.- Definovat taxon a druh.- Vysvětlit teorii biologické klasifikace. - Porovnat kladistikou a evoluční systematiku.- vysvětlit postupy používané ve fylogenetice - Vyjmenovat hlavní pravidla Mezinárodních pravidel botanické a zoologické nomenklatury.

Literatura

Felsenstein, J. Inferring Phylogenies. McNeill J. (ed.). International Code of Nomenclature for algae, fungi, and plants (Melbourne Code), 2011. Koeltz Scientific Books. International Comission on Zoological Nomenclature. International Code of Zoological Nomenclature, Fourth Edition. London, 1999. International Comission on Zoological Nomenclature. International Code of Zoological Nomenclature, Third Edition. London, 1985. Greuter, W. et al. Medzinárodný kód botanickej nomenklatúry (Saint Louis Code). Zpr. Čes. Bot. Společ., Praha, Příloha 2000/1: 1-121, 2000. Houša V. a Štys P. Mezinárodní pravidla zoologické nomenklatury, 3. vydání. Academia, Praha, 1988. Page, R. D. M. and Holmes, E. C. Molecular Evolution: A phylogenetic approach. Stuessy, T. F. Plant Taxonomy. New York, 1990. Stace, C. A. Plant Taxonomy and Biosystematics. London, 1980. Briggs D., Walters S.M. Plant Variation and Evolution. Cambridge University Press, 1997. Mayr, E. Principles of systematic zoology. McGraw-Hill Book Company, New York, 1969. Mayr, E. & Ashlock, P. D. Principles of systematic zoology. 2nd edition. McGraw- Hill, Inc., New York etc., 1991. Hall B. G. Trees Made Easy: A How - To Manual. Houša, V. Základy taxonomie pro zoopaleontology. Skripta PřF UK. Státní pedagogické nakladatelství, Praha, 1980.

Požadavky

ústní zkouška - 3 otázky: 1. botanická část, 2. zoologická část, 3. nomenklatura (podle specializace botanika/zoologie)

Garant

prof. Ing. Ladislav Bocák, Ph.D.doc. RNDr. Bohumil Trávníček, Ph.D.

Vyučující

prof. Ing. Ladislav Bocák, Ph.D.doc. RNDr. Bohumil Trávníček, Ph.D.