Předmět Rentgen. synchrotronová mikrotomografie (ZOO / PGSXR)

Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu ZOO / PGSXR - Rentgen. synchrotronová mikrotomografie, Přírodovědecká fakulta, Univerzita Palackého v Olomouci (UP).

Materiál	Typ	Datum	Počet stažení

Obsah

Synchrotronové rentgenové zobrazování používající odlišné aspekty mikrotomografie má široké využití pro nejrůznější experimentální aplikace mnoha vědeckých oborů. Úspěch těchto aplikačních technik je závislý od specifických vlastností rentgenových parpsků (vysoký tok, téměř paralelní paprsek, široký energetický rozsah, modulovatelné spektrum, částečná prostorová koherence, ...) produkovaných technologiemi synchrotronových zásobních prstenců třetí generace. V rámci všech možných oborů, synchrotron udělal (a stále dělá) nebývalý průlom ve vývoji aplikací pro účely biologických a paleontologických studii, a to zejména v možnosti použití technik propagačného fázoveho kontrastu, kvantitativní analýzy a vícerozměreného zobrazování s dosažením rozlíšení submikronové úrovně (například pro potřeby virtuální histologie).Tento kurz je tvořen dvěmi hlavními bloky. Prvním je přednáškový blok, který poskytuje základy teorie synchrotronové rentgenové mikrotomografie včetně rozmanitých efektů produkovaných specifickými vlastnostmi synchrotronových paprsků. Je take prezentaci růzmorodých dostupných skenovacích technik demonstrovaných na příkladech různých případových studií vybraných z oboru biologie a paleontologie. Druhý blok je pak na jedné straně tvořen praktickými demonstracemi jak získat primární data prostřednictvim alternativních nastavení parametrů skenovaní podle charakteru různých vzorků (s možností použití těch, které jsou klíčové pro výzkumné projekty studentů kurzu), a na straně druhé je tvořen praktickými příklady metodických postupů zpracování naměrených dat a jejich další analýzy.

Literatura

Tafforeau, P., Boistel, R., Boller, E., Bravin, A., Brunet, M., Chaimanee, Y., Cloetens, P., Feist, M., Hoszowska, J., Jaeger, J.-J., Kay, R.F., Lazzari, V., Marivaux, L., Nel, A., Nemoz, C., Thibault, X., Vignaud, P. and Zabler, S. Applications of X-ray synchrotron microtomography for non-destructive 3D studies of paleontological specimens. Applied Physics A, Materials Science & Processing. 83: 195-202., 2006. Sanchez, S., Fernandez, V., Pierce, S.E., and Tafforeau, P. Homogenization of sample absorption for the imaging of large and dense fossils with synchrotron microtomography. Nature Protocol. 8:1708-1717., 2013. Tafforeau, P., Bentaleb, I., Jaeger, J.-J. and Martin, C. Nature of enamel laminations and mineralization in rhinoceros enamel using histology and X-ray synchrotron microtomography: potential implications for palaeoenvironmental isotopic studies. Palaeogeography Palaeoclimatology Palaeoecology. 246: 206-227., 2007. Smith, T. and Tafforeau, P. New Visions of Dental Tissue Research: Tooth Development, Chemistry, and Structure. Evolutionary Anthropology. 17(5):213-226., 2008. Tafforeau, P. and Smith, T. M. Nondestructive imaging of hominoid dental microstructure using phase contrast X-ray synchrotron microtomography. Journal of Human Evolution. 54(2): 272-278., 2008. Fernandez V., Buffetaut E., Maire E., Adrien J., Suteethorn V. and Tafforeau P. Phase contrast synchrotron microtomography: improving non-invasive investigations of fossil embryos in ovo. Microscopy and Microanalysis.18:179-185., 2012. Lak, M., Néraudeau, D., Nel, A., Cloetens, P., Perrichot, V and Tafforeau, P. Phase contrast X-ray synchrotron imaging : Opening access to fossil inclusions in opaque amber. Microscopy and Microanalysis. 14: 251-259., 2008. Carlson K., Stout D., Jashashvili T., de Ruiter D. J., Tafforeau P., Carlson K. and Berger L. R. The endocast of MH1, Australopithecus sediba. Science. 333:1402-1407., 2011. Sanchez, S., Ahlberg, P. E., Trinajstic, K. M., Mirone, A., Tafforeau, P. Three Dimensional Synchrotron Virtual Paleohistology: A New Insight into the World of Fossil Bone Microstructures. Microscopy and Microanalysis. 18: 1095-1105., 2012. Tafforeau, P., Zermeno, J.-P., Smith, T. M. Tracking cellular-level enamel growth and structure in 4D with synchrotron imaging. Journal of Human Evolution. 62(3):424-428., 2012. Zanette, I., Bech, M., Rack, A., Le Duc, G., Tafforeau, P., David, C., Mohr, J., Pfeiffer, F., and Weitkamp, T. Trimodal low-dose X-ray tomography. PNAS. 109(26): 10199-10204., 2012.

Garant

prof. Ing. Stanislav Bureš, CSc.

Vyučující

prof. Ing. Stanislav Bureš, CSc.