Předmět Bioinformatické algoritmy (N143041)
Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu N143041 - Bioinformatické algoritmy, Fakulta chemické technologie, Vysoká škola chemicko-technologická v Praze (VŠCHT).
Top 10 materiálů tohoto předmětu
Materiály tohoto předmětu
| Materiál | Typ | Datum | Počet stažení |
|---|
Další informace
Sylabus
1. Úvod. Existující nukleotidové a proteinové databáze.2. Dynamické programování.3. Sekvenční podobnost DNA a RNA.4. Sekvenční podobnost proteinů.5. Vyhledávání motivů v DNA.6. Vícenásobná sekvenční podobnost.7. Fylogenetické stromy.8. Efektivní vyhledávání v databázích DNA, RNA a proteinových sekvencí.9. Algoritmy pro hmotnostní spektrometrii.10. Algoritmy pro podobnost proteinových struktur I.11. Algoritmy pro podobnost proteinových struktur II.12. Algoritmy pro podobnost RNA struktur.13. Predikce RNA struktury.14. Predikce proteinové struktury.
Literatura
Z: Zvelebil, M., Baum J.: Understanding Bioinformatics, Garland Science; 1 edition, 2007, 0815340249Z: Durbin, R., et al.: Biological Sequence Analysis: Probabilistic Models of Proteins and Nucleic Acids, Cambridge University Press, 1998, 0521629713D: Mount, D.W.: Bioinformatics: Sequence and Genome Analysis, Second Edition, Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2004, 0879696087D: Gusfield, D.: Algorithms on Strings, Trees and Sequences - Computer Science and Computational Biology, Cambridge University Press, 1997, 0521585198D: Jones, N.C., Pevzner, P.A.: An Introduction to Bioinformatics Algorithms, The MIT Press, 2004, 0262101068
Garant
Hoksza David RNDr. Ph.D.