Předmět Případové studie z bioinformatiky (N143051)
Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu N143051 - Případové studie z bioinformatiky, Fakulta chemické technologie, Vysoká škola chemicko-technologická v Praze (VŠCHT).
Top 10 materiálů tohoto předmětu
Materiály tohoto předmětu
| Materiál | Typ | Datum | Počet stažení |
|---|
Další informace
Sylabus
1. Úvod2. Assembly bakteriálního genomu - Achromobacter3. Eukaryotický genomový projekt I - Mastigamoeba, sestavení z 454, Illumina a PacBio sekvencí4. Eukaryotický genomový projekt II - repetice a jiné problémové úseky, evaluace sestavení5. Eukaryotický genomový projekt III - predikce genů, anotace6. RNA-Seq na známém genomu, expresní analýza7. Explorativní RNA-Seq neznámých genomů - Cobitis8. Expresní analýza nádorových tkání pomocí mikročipů9. Metagenomika, analýza polutované spodní vody10. Fylogenetická analýza epidemie SARS11. Komparativní genomika, Burkholderia12. Epigenetická analýza, melanomy13. ENSEMBLE api14. Genotypová analýza, porfýrie
Literatura
Z: Rodriguez-Ezpeleta N., Hackenberg M., Aransay A. M. (Eds.), Bioinformatics for High Throughput Sequencing, Springer 2012, ISBN 978-1-4614-0781-2Z: Cristianini N., Hahn W., Introduction to Computational Genomics. A case studies approach, Cambridge University Press 2012, ISBN: 978-0-521-67191-0D: Brown S. M. (Ed.), Next-Generation DNA Sequencing Informatics, Cold Spring Harbor Laboratory Press 2012, ISBN: 978-1-936113-87-3D: Hahne F., Huber W., Gentleman R., Falcon S., Bioconductor Case Studies, Springer 2008, ISBN: 978-0-387-77240-0
Garant
Pačes Jan Mgr. Ph.D.