Předmět Bioinformatika (FEKT-ABIN)
Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu FEKT-ABIN - Bioinformatika, Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií, Vysoké učení technické v Brně (VUT).
Top 10 materiálů tohoto předmětu
Materiály tohoto předmětu
| Materiál | Typ | Datum | Počet stažení |
|---|
Další informace
Cíl
Cílem předmětu je poskytnout studentům základní orientaci v problematice bioinformatiky, konkrétně v náhledu na strukturu informací v biologických databázích a způsob jejich využití a metodách analýzy sekvencí získaných z biologických databází.
Osnova
1. Sekvenace a obsah genomu.2. Biologické sekvence, genomické a proteomické databáze.3. Základní principy zarovnávání biologických sekvencí.4. Algoritmy zarovnávání biologických sekvencí.5. Skórování a skórovací systémy.6. Zarovnávání více sekvencí.7. Fylogenetika a fylogenetické stromy.8. Konstrukce fylogenetických stromů.9. Identifikace motivů v sekvencích.10. Algoritmy a optimalizace identifikace motivů.11. Predikce proteinových struktur.
Literatura
F. Cvrčková: Úvod do praktické bioinformatiky. Praha : Academia, 2006. ISBN 80-200-1360 (CS)A. D. Baxevanis, B. F. F. Ouellette: Bioinformatics – A Practical Guide to the Analysis of Genes and Proteins. Wiley-Interscience, 2005. ISBN 0-471-47878-4 (EN)Rosypal, S. Nový přehled biologie. Scientia, Praha 2003. ISBN 80-7183-268-5 (CS)
Požadavky
Student by měl být schopen vysvětlit základní principy klasické genetiky, měl by znát základní pojmy a zákony molekulární biologie a měl by ovládat základní znalosti z číslicového zpracování signálů. Obecně jsou požadovány znalosti na úrovni středoškolského studia.
Garant
prof. Ing. Ivo Provazník, Ph.D.
Vyučující
prof. Ing. Ivo Provazník, Ph.D.