Předmět Pokročilá analýza rozsáhlých genomických dat (FEKT-DBT1)
Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu FEKT-DBT1 - Pokročilá analýza rozsáhlých genomických dat, Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií, Vysoké učení technické v Brně (VUT).
Top 10 materiálů tohoto předmětu
Materiály tohoto předmětu
| Materiál | Typ | Datum | Počet stažení |
|---|
Další informace
Cíl
Cílem předmětu je poskytnout přehled o aktuálních tématech v oblasti zpracování biologických sekvencí se zaměřením na determnistické a pravděpodobnostní metody.
Osnova
1. Principy reprezentace genomických dat.2. Deterministické vyjádření sekvencí v prostoru.3. Teorie fraktálů v reprezentaci sekvencí.4. Deterministické modely evoluce sekvencí.5. Pravděpodobnostní modely evoluce sekvencí.6. Pokročilé principy fylogenetiky.7. Metody konstrukce rozsáhlých fylogenetických stromů.8. Kvalita ve fylogenetice.9. Principy reprezentace proteomických dat.10. Pokročilé kódování proteomických dat.11. Vyhledávání motivů v genomických a proteomických sekvencích.
Literatura
Snustad, D. P., Simmons, M. J. Genetika. Nakladatelství Masarykovy univerzity, Brno, 2009.Higgs, P. G., Attwood, T. K. Bioinformatics and Molecular Evolution. Blackwell Publishing, 2005.Yang, Z. Computational Molecular Evolution. Oxford University Press, 2006.Mandoiu, I. I., Zelikovski, A. Bioinformatics Algorithms. A John Wiley Publishing, 2008.
Požadavky
Základy molekulární biologie. Základy bioinformatiky a zpracování biologických sekvencí.
Garant
prof. Ing. Ivo Provazník, Ph.D.
Vyučující
prof. Ing. Ivo Provazník, Ph.D.