Předmět Bioinformatika (FIT-BIF)
Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu FIT-BIF - Bioinformatika, Fakulta informačních technologií, Vysoké učení technické v Brně (VUT).
Top 10 materiálů tohoto předmětu
Materiály tohoto předmětu
| Materiál | Typ | Datum | Počet stažení |
|---|
Další informace
Cíl
Porozumět základním principům v oblasti molekulární biologie z pohledu informatiky. Obdržet znalosti o používaných výpočetním algoritmech a přístupech. Získat schopnost navrhovat nové efektivní metody pro analýzu biologických dat.
Osnova
Osnova přednášek:Úvod do bioinformatiky Základy molekulární biologie z pohledu informatiky Nástroje molekulární biologie Databáze biologických dat Zarovnání sekvencí, dynamického programování, BLAST, FASTA Evoluční modely Konstrukce fylogenetických stromů Sestavování fragmentů DNA Genomika a rozpoznávání genů Proteiny a predikce jejich struktury Výpočet sekundární struktury RNA Proteomika, regulační sítě Polymorfizmus genů a diverzita Osnova počítačových cvičení:Databáze biologických dat Zarovnání sekvencí Konstrukce fylogenetických stromů Analýza struktury proteinů Osnova ostatní - projekty, práce:Studenti vypracují projekt související s tematikou předmětu. Hodnotit se bude realizace, prezentace a dokumentace projektu.
Literatura
Jacques Cohen: Bioinformatics - An introduction for Computer Scientists, ACM Computing Surveys, 2004, Vol. 36, No. 2, p. 122-158. Jean-Michel Claverie, Cedric Notredame: Bioinformatics for Dummies, ISBN: 0-7645-1696-5, Wiley Publishing, Inc., 2003. Yi-Ping Phoebe Chen: Bioinformatics Technologies, ISBN: 3540208739, Springer, 2005. Alberts, Bray, Johnson, Lewis, Raff, Roberts, Walter: Základy buněčné biologie, ISBN: 80-902906-0-4, Espero Publishing, 1998. Dan K. Krane, Michael L. Raymer: Fundamental Concepts of Bioinformatics, ISBN: 0-8053-4633-3, Benjamin Cummings 2003. Fatima Cvrčková: Úvod do praktické bioinformatiky, ISBN: 80-200-1360-1, Academia, 2006. Neil C. Jones, Pavel A. Pevzner: An Introduction to Bioinformatics Algorithms, ISBN: 0262101068, MIT Press, 2004. Andreas D. Baxevanis, B. F. Francis Ouellette: Bioinformatics: A Practical Guide to the Analysis of Genes and Proteins, ISBN: 0-471-47878-4, Wiley-Interscience, 2005.
Požadavky
Nejsou žádné prerekvizity.
Garant
Ing. Tomáš Martínek, Ph.D.
Vyučující
Ing. Tomáš Martínek, Ph.D.