Předmět Buňka a buněčná mechanika (KME / BBM)

Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu KME / BBM - Buňka a buněčná mechanika, Fakulta aplikovaných věd, Západočeská univerzita v Plzni (ZČU).

Materiál	Typ	Datum	Počet stažení

Obsah

1. týden:Přednáška - Rozdělení buněk na prokaryotické a eukaryotické (rostlinné a živočišné) a jejich základní rozdíly, velikost, tvar a struktura. Složení buněk: cytoskelet, membránový skelet, cytosol a membránové organely. Mimobuněčná hmota a její mechanické vlastnosti. Buněčné spoje a adhézní molekuly. Typy tkání (epitelová, pojivová, svalová, nervová), jejich výskyt a funkce.2. týden:Přednáška - Popis cytoskeletu a membránového skeletu. Funkce cytosleketu. Vizualizace cytoskeletu: světelná mikroskopie, video mikroskopie, fluorescenční mikroskopie, elektronová mikroskopie. Tři základní složky cytoskeletu (aktinová filamenta, mikrotubuly, střední filamenta), jejich velikost, struktura, funkce, stabilita a mechanické vlastnosti. Proteiny asociované s cytoskeletární sítí.3. týden:Přednáška - Buněčný pohyb. Buněčné motory. Dendritický nukleární model tvorby lamlipodií. Pohyb podél mikrotubulů (kinesin, dynein). Pohyb podél aktinových filament (myosin). Ameboidní pohyb. Pohyb pomocí řasinek a bičíků. Aktomyosinový pohyb (dělení buněk, svalová kontrakce). Protonová pumpa. Signálování cytoskeletu.4. týden:Přednáška - Mechanické vlastnosti buněk - elastické, viskózní. Reologie, mikroreologie. Základní přehled měřicích technik na buněčné úrovni.5. týden:Přednáška - AFM (mikroskopie atomárních sil) - kontaktní, bezkontaktní. Základní princip. Příklady použití - vyhodnocení získaných dat.6. týden:Přednáška - Micropipette aspiration (odtrhávání mikropipetou). Základní princip. Příklady použití - vyhodnocení získaných výsledků.7. týden:Přednáška - Traction force microscopy (mikroskopie trakčních sil). Základní princip. Příklady použití - vyhodnocení získaných výsledků.8. týden:Přednáška - Optické měřící metody: optická pinzeta, optická past, Brownův pohyb. Základní principy. Příklady použití - vyhodnocení získaných výsledků.9. týden:Přednáška - Magnetické měřící metody: magnetická pinzeta, magnetická torzní cytometrie. Základní principy. Příklady použití - vyhodnocení získaných výsledků.10. týden:Přednáška - Měřící metoda dvou mikrodesek: tahová, tlaková zkouška. Základní principy. Příklady použití - vyhodnocení získaných výsledků.11. týden:Přednáška - Shear flow methods (metody smykového toku). MEMS. Základní principy. Příklady použití - vyhodnocení získaných výsledků.12. týden:Přednáška - Porovnání jednotlivých měřících technik. Faktory ovlivňující mechanické vlastnosti buněk a buněčných komponent.13. týden:Přednáška - Modelování na molekulární a buněčné úrovni: semi-flexibilní polymery, MKP, tensegrity, reologie poddajných skel. Opakování.

Získané způsobilosti

Studenti získají základní informace o buňce a buněčných komponentách. Dále se seznámí s experimentálními technikami pro měřění těchto 'měkkých' struktur a porozumí základním principům těchto technik.

Literatura

Alberts, Bruce. Molecular biology of the cell. 4th ed. New York : Garland Science, 2002. ISBN 0-8153-3218-1.Boal, David. Mechanics of the cell. 1st pub. Cambridge : Cambridge University Press, 2002. ISBN 0-521-79681-4.Alberts, B., Bray, D., Johnson, A., Lewis, J., Raff, M., Roberts, K., Walter, P. Základy buněčné biologie: Úvod do molekulární biologie buňky (vybrané kapitoly). Espero Publishing, Ústí nad Labem, ČR., 1998.

Požadavky

Požadavky k zápočtu: Úspěšné vypracování zápočtového testu.Požadavky ke zkoušce: Aktivní znalost přednášené látky a schopnost orientovat se v moderních metodách používaných v buněčné a molekulární mechanice.

Garant

Ing. Petra Kochová, Ph.D.