Aminokyseliny, bílkoviny

Aminokyseliny

• Základní stavební jednotky pro tvorbu peptidů a bílkovin/proteinů

• existuje 20 kódovaných aminokyselin (alanin, glycin, izoleucin, leucin, prolin, valin, fenylalanin, tryptofan, tyrozin, kyselina asparagová, kyselina glutamová, arginin, histidin, lyzin, serin, threonin, cystein, methionin, asparagin, glutamin)

• Tvoří enantiomery L a D

  • přírodní aminokyseliny jsou L x přírodní sacharidy jsou D

• izoelektrický bod = hodnota pH, při které vzniká zwitterion/amfion (v jedné AK je zároveň NH3+ a COO- skupina)

• aminokyseliny můžeme rozdělit podle pH

  • neutrální – mají stejný počet COOH a NH2 skupin

  • kyselé– mají více COOH skupin než NH2 skupin

  • bazické – mají více NH2 skupin než COOH skupin

• aminokyseliny můžeme rozdělit podle složení:

  • proteinogenní/kódované – 20, slouží k výrobě peptidů a proteinů (spojením přes peptidickou vazbou)

  • nebílkovinné – např. L-karnitin, L-ornithin, L-citrulin

Bílkoviny

• Součástí všech živých organismů na zemi

• Funkce: stavební látka, tvoří enzymy - katalýza chemických reakcí, imunita, receptory, signální molekuly – hormony

• jejich stavba se liší v závislosti na jejich funkci

Struktura:

• primární

  • pořadí jednotlivých aminokyselin za sebou

  • dána peptidovou vazbou (= kovalentní vazba)

  • 2 konce:

    • C- konec končí COOH skupinou

    • N- konec končí NH2 skupinou

• sekundární

  • stočení a zamotání vlákna

  • dána nekovalentní vazba – vodíkovými můstky

  • 2 druhy

    • α-helix – šroubovice

    • β-skládaný list – šroubovice poskládaná jako harmonika

• terciální

  • nekovalentní interakce (disulfidické můstky, VdW síly, iontové vazby, …)

  • Zamotání šroubovice

  • 2 druhy

    • Fibrilární – vlákno

    • Globulární – kulička

• Kvarterní

  • Spojení 2 bílkovinných domén

  • zajišťují nekovalentní interakce

Dělení bílkovin:

• jednoduché - pouze bílkovinný charakter

  • skleroproteiny – vláknité, nerozpustné ve vodě

    • keratin, kolagen, …

  • Sferoproteiny – kulaté, rozpustné ve vodě

    • Albuminy, globuliny, histony, …

• složené - obsahují bílkovinu a další látku

  • fosfoproteiny

    • kasein

  • chromoproteiny (obsahují barvivo)

    • hemoglobin

  • lipoproteiny

  • metaloproteiny (obsahují kov)

    • transferin - přenáší železo v krvi

  • nukleoproteiny

  • glykoproteiny

    • lepek