Vypracovane-otazky-ke-zkousce

 konsenzuální sekvence – 10 paměťového řetězce = TATAAT – tzv. TATA box  tvořena A – T pb a je místem zahájení despiralizace (unwinding) a oddělování řetězců DNA

 konsenzuální sekvence – 35 paměťového řetězce = TTGACA – tzv. Pribnow box  sigma faktor rozpoznává a váže se na – 35 sekvenci = tzv. rozpoznávací sekvence

 vzdálenost mezi TATA boxem a Pribnow boxem je vysoce konzervovaná (15 – 20 pb)  změna počtu bazí mění funkci promotoru

1. Elongace

= syntéza RNA ve směru 5'  3', katalyzovaná RNA-polymerázou již bez sigma faktoru

• RNA-polymeráza využívá jako matrici pracovní řetězec DNA

• po rozpoznání promotoru a se podle komplementarity bází k pracovnímu vláknu DNA nasyntetizuje RNA vlákno (pozor: místo T je U).

• prodlužování probíhá v místě transkripční bubliny, kde je v rozsahu 18 bp despiralizována DNA a její řetězce jsou odděleny

• RNA-polymeráza má schopnost jak despiralizace tak i respiralizace DNA

• s posunem RNA-polymerázy po vlákně DNA se postupně prodlužuje vznikající RNA

1. Terminace

   • je řízena terminačním signálem

Posttranskripční úpravy:U bakterií a prokaryot obecně k žádným posttranskripčním úpravám mRNA nedochází  mRNA nemá introny, takže nasyntetizovaná mRNA neprodělává ani posttranskripční úpravy (processing) před translací.

Prokaryota nemají jadernou membránu  na mRNA se váží ribosomy již v průběhu transkripce

Transkripce i translace probíhají na stejném místě a téměř ve stejném čase

87. KONJUGACE, TRANSFORMACE, TRANSDUKCE

• parasexuální děje u bakterií

• slouží pro přenos genetické informace:

1. Konjugace = postupný, regulovatelný proces

   • u mikrobů = analogie pohlavního rozmnožování vyšších organismů

   • jde o spojené bakterií, při němž dochází k přechodu dědičné informace (DNA) z jedné do druhé

   • dochází k vytvoření cytoplazmatického spojení mezi dvěma bakteriemi v podobě úzké trubičky  přenos části genetického materiálů z dárcovské buňky do buňky příjemce

   • o schopnosti přenést část své genetické výbavy do druhé bakterie  rozhoduje přítomnost sex-chromatinu (F-faktoru)  buňky F+ nebo Hfr

   • u F+ tvoří F-faktor samostatnou součást její genetické výbavy  F-plazmid

   • u Hfr  integrován v hlavním – bakteriálním chromosomu (epizóm)

   • fenotypovým projevem přítomnosti F-faktoru je přítomnost tzv. F-pilií na povrchu bakterie

   • důležitá pro mapování bakteriálního chromosomu  při konjugaci dochází k postupnému přesouvání chromosomového vlákna z 1 bakterie do druhé

1. Transformace

   • přenos dědičných vlastností z jednoho kmene mikrobů na druhý

   • zpětná rekombinace geneticky aktivního materiálu, při které jsou alely přenášeny do recipientních buněk prostřednictvím DNA, izolované nebo uvolněné z buněk donorových

   • přenos genetické informace do bakterie přímo z DNA, vnesení plazmidu do bakterie v rámci klonování

2. Transdukce = převod

   • přenos části genetické informace (DNA) z jedné (donorové) bakterie do druhé (recipientní), prostřednictvím bakteriofágu

   • způsob genetické rekombinace

   1. generalizovaná (obecná)  fág je schopen přenosu z donorové buňky do buňky recipientní, kterékoli části donorového chromosomu

   2. abortivní  fragment donorového chromosomu se v hostiteli nereplikuje

   3. specializovaná (restringovaná)  mírný bakteriofág přenáší z donora do recipienta pouze určitou část jeho chromosomu