Vypracovane-otazky-ke-zkousce

POSTTRANSKRIPČNÍ ÚPRAVY

RNA polymerasa se připojuje v oblasti promotoru k pracovnímu vláknu DNA dochází k vytvoření vlákna RNA na základě komplementarity bazí ve směru 5´ 3´. V případě mRNA se transkribuje úsek přibližně 100 pb dlouhý před začátkem kódu pro pořadí aminokyselin v polypeptidu. Primární transkript je na 5' konci vybaven tzv. čepičkou vytvořenou zvláštním nukleotidem (7-methylguanosintrifosfát) a na opačném 3' konci je vybaven tzv. polyadenilovým koncem (asi 200 adeninových zbytků)  pravděpodobně se tento úsek podílí na transportu mRNA z jádra do cytoplazmy. Dále ještě prochází tzv. sestřihem.

Ve většině genů eukaryot se nacházejí úseky, které neobsahují informaci nutnou pro funkci genového produktu = introny(části řetězce nekódující žádné aminokyseliny); úseky nesoucí informaci pro produkt = exony;

Lasovitým stáčením (pomocí snRNA je vytvořena smyčka, ve které je intron obsažen) primárního transkriptu dochází k odstřižení intronů = tzv. sestřih  kódující úseky (exony) jsou pak enzymaticky pospojovány do finálního řetězce. Odstřižené introny jsou ihned odbourávány.

Editace = pochod, při kterém jsou do mRNA některé nukleotidy přidávána nebo chemicky měněny

Pozn. počet intronů je do určité míry úměrný velikosti genomu; introny lze dělit do řady různých typů  klasické introny jsou nejčastější – některé sekvence bazí se u těchto intronů vyskytují pravidelně = sekvence GU na začátku = donor, a sekvence GA na konci = akceptor.

Některé jiné typy intronů jsou specifické pro určité organismy nebo buněčné organely, např. typ II se vyskytuje v mitochondriální a chloroplastové DNA.

Promotor  směrem k 5´konci pracovního vlákna DNA před začátkem transkripce; bývá proměnlivé délky, obvykle kolem 300 – 400 pb;

• funkcí je označení začátku transkripce a podílí se na regulaci její intenzity

• v oblasti promotoru se často vyskytují tzv. signální sekvence  30 – 40 pb před začátkem transkripce bývá tzv. TATA box – obsahuje vyšší množství T a A; další známou signální sekvencí je CCAAT box – obvykle na pozici – 75 – 80 pb – u genů, které jsou touto signální sekvencí vybaveny je její přítomnost podmínkou účinné transkripce

• existuje řada genů, které neobsahují ani TATA ani CCAAT box  většinou geny vyskytující se v každé buňce – houskeeping genes  př. geny determinující enzymy citrátového cyklu

Enhancery = „zesilovače“  úseky DNA, které mohou být od genu, který ovlivňují, značně vzdáleny

• jde o krátké sekvence, jejichž funkce není ovlivněna vzdáleností od řízeného genu, a mohou působit jak ve směru 5´ 3´, tak i naopak

• jejich účinek je podobný jako u promotoru

42. TRANSLACE, POSTTRANSLAČNÍ ÚPRAVY PROTEINŮ

TRANSLACE = přenos genetického kódu mRNA do pořadí aminokyselin v polypeptidovém vláknu