Vypracovane-otazky-ke-zkousce

1. regulační genová kaskáda:

Primárně regulované geny 

Produkt I 

Další gen řetězce aktivován 

Produkt II 

Exprese dalších genů regulačního řetězce 

Případné suprese primárně aktivovaných genů 

1. regulace úpravou pre-mRNA

   • po transkripci pre-mRNA a navázání 5´ čepičky v průběhu transkripce  úprava pre-mRNA:

1) odštěpením 3´konce a připojení poly(A)

2) sestřih intronů a spojení exonů

• alternativní sestřih

• editace mRNA  změna struktury pre-mRNA

• stabilita mRNA v cytoplazmě

1. regulace na úrovni translace

   • př. translace mRNA pro tvorbu ferritinu

2. targetting  genetická determinace nasměrování proteinů

47. TRANSLACE MEMBRÁNOVÝCH A EXKREČNÍCH PROTEINŮ (targeting)

Targeting – odeslání nových proteinů k místu jejich určení

• o základním nasměrování polypeptidů rozhoduje místo jejich syntézy na volných ribosomech v cytosolu nebo na ribosomech v GER; volné ribosomy – zůstávají v cytosolu; ribosomy GER – secernovány z buňky, event. směřovány do GK, lysozomů nebo jsou zabudovány jako integrální proteiny do membrán

I.  o směřování polypeptidů rozhoduje sekvence asi 75 bazí na 5´konci mRNA = tzv. topogenní sekvence

• základní směr transportu proteinů je: cytosol – GER – transportní vezikuly – GK – sekreční vezikuly – exocytosa

  • proteiny určené k sekreci mají po zahájení translace na počátku tzv. vedoucí (leader) sekvenci [16 – 30 AMK] – tvořena hydrofobními AMK s pozitivním nábojem (Phe, Leu, Ser, atd.)

• translace proteinů exkrečních je iniciována navázáním mRNA na ribosom v cytosolu  translace je zastavena po asi 70 AMK  na vedoucí sekvenci vznikajícího polypeptidu se naváže na receptor SRP na GER  vedoucí sekvence vstoupí do membrány GER, kde ji váže specifický protein – SSB  transmembránové proteiny vytvářejí kolem polypeptidu transmembránový kanál  translace proteinu pokračuje  SRP a receptor SRP se energií GTP uvolní z vazby

• na vznikající protein se v lumen GER naváže tzv. Bip protein (binding)  brání předčasné degradaci vznikajícího polypeptidu a spolu s dalšími proteiny posouvá translatovaný lineární popypeptid kanálem do GER

  • v nepřítomnosti Bip je elongace blokována

 vedoucí sekvence je odštěpena signální peptidasou a degradována  vznikající polypeptid je ihned v GER modifikován (glykosylace) a konformován  až po dokončení posttranslačních úprav prochází kanálem i C-konec proteinu  transmembránový kanál se rozpadá

• mutací zkrácený nebo chybně modifikovaný polypeptid je v GER degradován

• nově syntetizované proteiny  přenášeny so GK transportními vezikulami  k buněčné membráně – transportními a sekrečními vezikulami