Biologie člověka

Trans fáze (Ab x aB – nerekombinovatelné), rekombinační jsou vždy vzácnější (18 + 20/20 + 18 + 378 + 384)=0,0475 (skoro 5cM)

Mapy

• Genetická:

  • Na základě zjištění vazeb je možné určit relativní vzdálenost genů

  • Vzdálenost určuje pravděpodobnost rekombinace mezi zvolenými lokusy – nízká míra rekombinace indikuje blízkost sledovaných lokusů

• Fyzická:

  • Přesně určuje pozici genu v chromosomu např. metoda FISH, sekvenování…

  • Projekt HUGO – celkový genom člověka

  • Zjištění sekvence DNA všech 23 chromosomů

  • V sekvenci hledat charakteristické motivy určující např. oblast promotoru, strukturního genu, repetitivně sekvence a mnoho dalších

  • K nalezeným sekvencím genům hledat konkrétní protein

• Cytogenetická

• Nulovým bodem je centromera

• Určování genetické mapy u lidí:

  • Frekvence rekombinace lokusů u většiny chromosomů je větší u žen – proto jsou genetické mapy ženských chromosomů

  • Sledování znaků u nejméně tří generací rodiny, čím početnější rodokmen, tím lépe lze hodnotit frekvenci rekombinací

  • U lidí je obecně málo potomků ke sledování štěpných poměru v F1 generaci

  • Ke studiím genetické mapy u lidí mohou např. sloužit vzorky krve početné rodiny mormonů v Utahu

• Aplikace map:

  • Přibližně 1cM = 700 000 bp (párů bází) – určeno na základě sledování chiasmat v průběhu meiózy u vybraných markerů

  • Lokalizace a identifikace mutovaných genů

  • Genová vazba mezi vybraným markerem a genem asociovaným s určitým onemocněním metodika k odhalení podstaty onemocnění je vedená do oblasti markeru

  • Genetický marker – známá sekvence DNA, která může být jednoduše identifikována

  • Například – metoda RFLP – vazba restrikčního místa se sledovaným genem a vazba extragenové sondy se sledovaným genem

• Haplotypy:

  • Bloky sousedících genů, které se zpravidla dědí společně

  • Haplotyp (zkratka) = haploidní genotyp

  • Jeden ze současných názorů na variabilitu lidského genomu říká, že chromosomy jsou složen především z krátkých segmentů, které v rámci krátké evoluční historie člověka prodělaly minimální počet rekombinačních změn a proto tyto segmenty je možné u většiny populace charakterizovat jen několika částečnými haplotypy

  • Haplotyp může představovat sadu dvou a více míst (až po kompletní chromosom) v závislosti na počtu rekombinací, které se vyskytly v rámci dané sady

  • Celá kombinace alel představující haplotyp je přenášena společně (nebo s minimem rekombinací)

  • Haploskupina je skupina haplotypů, což jsou kombinace alel na různých místech daného chromosomu

  • Příklad:

• Vazebná analýza

• Opakování:

  • Př. Dítě syndrom 47, XY + 21:

    • Downův syndrom

    • Karyotyp rodičů – 46 XX, 46 XY